九江不守，武汉危矣。由于张发奎违抗坚守九江的军令，匆忙撤退，被认为是保存实力、畏敌不战，令郑三发子大为恼火。7月31日，张发奎被撤销职务，返回武汉待命，他的第2兵团交由第九战区第一兵团司令薛岳指挥——当然，这是后话。

此战，九江一半以上县城的房屋被焚毁殆尽。九江战役后，城区人口由之前的85万人锐减到2万多人，大中路上、牯岭镇里，不知有多少房屋、别墅长期无人居住，无数店铺关门倒闭，无数家庭的财富化为乌有，大批田地荒芜。

至此，长江与洞庭湖的最后阻碍被鬼子拔除，国军江西地区部队已无法以最短路径增援武汉，只能绕远路自江西绕湖南再北上武汉，支援效率大大降低；同时更无法从洞庭湖出击威胁鬼子依托于长江的航道，鬼子自此消除了依托长江航线为后勤的华中派遣军后顾之忧。

鬼子当即便兵分两路，一路由长江西进，准备进攻瑞昌；一路则由海军搭载第101师团经湖口杀入洞庭湖。